Stasiun Garut dibangun bersamaan dengan pembangunan jalur Cibatu–Garut.

Pada awalnya, pembangunan jalur ini bertujuan untuk menghubungkan jalur utama lintas selatan Jawa dengan pusat pemerintahan Garut.

Jalur ini kemudian diperpanjang hingga Cikajang untuk memperluas cakupan layanan. Jalur kereta api dari Cicalengka hingga Garut diresmikan pada tanggal 14 Agustus 1889 oleh Gubernur Jenderal Pijnacker Hordijk bersama istrinya, setelah melalui pekerjaan yang intensif selama dua tahun.

Bangunan stasiun yang lama kini telah digantikan dengan bangunan modern yang mirip dengan Stasiun Karawang dan Rambipuji.

Pada tahun 1947, stasiun ini sempat rusak akibat serangan tentara Belanda, namun berhasil direnovasi.

Hingga tahun 1980-an, Stasiun Garut masih aktif dan ramai dikunjungi oleh pengguna jasa angkutan kereta api.

Namun, pada tahun 1983, stasiun ini ditutup karena sarana yang sudah tua dan kalah bersaing dengan mobil pribadi serta angkutan umum.

Selain itu, kerugian yang dialami oleh PJKA akibat penumpang gelap juga menjadi salah satu alasan penutupan stasiun ini.

Selama masa nonaktifnya, stasiun ini sempat digunakan sebagai kantor sekretariat MPC Pemuda Pancasila Garut dan emplasemennya berubah menjadi pasar.

Bangunan stasiun yang dulu megah kini hanya menjadi saksi bisu dari kejayaan masa lalunya.